Journal of Indonesian Aquaculture Reserch memuat artikel yang bersumber langsung dari hasil penelitian, artikel review dan short communication yang berhubungan dengan bidang akuakultur yang mencakup budidaya perairan, kualitas air, ekologi perairan, kesehatan ikan, genetika ikan, nutrisi ikan, sistem dan teknologi perikanan, fisiologi ikan, bioteknologi, dan planktonologi. Terbit pada bulan April dan Oktober setiap tahunnya.